3文理解：微量样本甲基化测序在肿瘤中的应用

步骤：

所写首先通过61 四组WGBS数据集推测了MHB(丝氨酸单倍型号个位)，接着借助于101 四组RRBS数据集和637四组丝氨酸闪存数据集对MHB顺利进行测试。成立丝氨酸单倍型号负载（MHL）基本概念号，顺利进行四一个组织抗原MHB科学研究，就此用到29个WGBS数据集和14个RRBS数据集以及59个RRBS数据集（乳恶性肿瘤病患毒素）；10个RRBS数据集（和毒素组合成的中三状腺四一个组织）；75个RRBS数据集（比对毒素）对基本概念号顺利进行体能训练和测试（绘出新1）。

结果：

由61四组WGBS数据集成立的MHBs代表了一种独特的突变四组相似性，它与多个已确定的突变四组积体电路部分隔开(绘出新2)。在所有MHBs中都，60828个(41.1%)位于突变间隔的区，87060个(58.9%)位于转录的区。这些MHBs在增强子、超级增强子、位点、CpG岛和纹身突变上非同著硫化物(P 绘出新2

为了只能对许多比对中都单个MHBs中都的丝氨酸方式在顺利进行化学合成科学研究，所写须要一个单一的乘积来并不一定每个个位中都多个CpG亚基的丝氨酸方式在。理想情况下下，这一举例来说不仅是个位中都所有CpG亚基的最少丝氨酸高水平的函数，而且还可以捕捉单个DNA分子会上的共丝氨酸方式在。因此，所写并不一定了丝氨酸单倍型号负载(MHL)，对比其他化学合成步骤，NHL发挥出新能够的MHB划分能力（绘出新3）。

所写推测四一个组织抗原MHL在乳恶性肿瘤病患尿液中都依赖于，但在但会尿液或全血中都无法验证到，因此四一个组织抗原MHL在其所的四一个组织和乳恶性肿瘤尿液中都可见，这得出新结论四一个组织起源于标测的可行性（绘出新4a）。接着，所写在基于10个人类但会四一个组织的WGBS和RRBS数据集临近都，筛选出新兼具四一个组织抗原的MHB（绘出新4b），将量度基本概念号科学研究方法于来自乳恶性肿瘤病患和但会幼体的尿液电子束,量度真实性最少超越82.8%, 88.5%, 91.2%（分别是CCP,LCP和NCP比对）（绘出新4c）。

这项科学研究得出新结论，尿液中都的ctDNA丝氨酸单倍型号检查和可能是是一种用作早期验证中三状腺及其主要生长手部，以及整年数据分析中三状腺进展和多脑部移出新的有效举例来说。

期刊：Proc Natl Acad Sci U S A.

2021冲击特异性: 11.205

发表间隔时间：2017.5

简述：

用到微创切片定位特定乳恶性肿瘤对于提高乳恶性肿瘤的病患、疗程考虑和生存率量度上有很大的尽力。借助于来自乳恶性肿瘤突变四组绘出新谱(TCGA)的全突变四组丝氨酸数据集和机器学时习步骤，所写评估了DNA丝氨酸在划分四种典型乳恶性肿瘤(乳腺恶性肿瘤、住院、食道恶性肿瘤和呼吸系统恶性肿瘤)中三状腺四一个组织和但会四一个组织中都的有效性。所写在1,619个中三状腺比对和173个周边地的区但会四一个组织比对的体能训练数据集流中都具体了乳恶性肿瘤上面物。所写的推测在一个另行的TCGA数据集流中都取得了测试，DNA丝氨酸科学研究可以量度乳恶性肿瘤和但会四一个组织，统计科学研究超过95%，同时也可靠地将30个移出新到肝脏的结直肠恶性肿瘤中都的29个和34个移出新到呼吸系统的结直肠恶性肿瘤中都的32个具体下来。所写推测这种验证步骤还可以量度病患的生存率和存活率。综上所述，这些推测证明了丝氨酸生物上面物对描绘乳恶性肿瘤分子会相似性的作用，并对病患和生存率有一定的含意。

结果：

与不尽相同乳恶性肿瘤一般来说号的丝氨酸情况下方面的无指导等级聚类和热绘出新揭示，丝氨酸绘出新谱只能定位乳恶性肿瘤抗原丝氨酸相似性。ROC曲线得出新结论，对不尽相同中三状腺一般来说号的量度兼具较高的一般来说和抗原，因此丝氨酸相似性可以划分不尽相同的乳恶性肿瘤一般来说号和其所的但会四一个组织（绘出新1）。

由于定位起源于四一个组织对于中三状腺移出新病患考虑最佳的疗程思路是至关极为重要的，因此除了原发中三状腺外，所写还科学研究了30亦然结直肠恶性肿瘤肝移出新和34亦然结直肠恶性肿瘤呼吸系统移出新病亦然。科学研究推测，无指导标准聚类可以将这些移出新与住院或但会四一个组织划分开来(绘出新2)。

接下来，所写评估了丝氨酸上面对每种乳恶性肿瘤的生存率效果。该基本概念号在Kaplan-Meier科学研究中都划分高高风险四组和长期性四组以及兼具非同著P参数的方面对数等级检查中都发挥良好，得出新结论丝氨酸标签在一定程度上可以量度BRCA和LUAD的生存率。

鉴于DNA丝氨酸是突变表达的极为重要调控遗传调节特异性，所写科学研究了乳恶性肿瘤和但会四一个组织中都突变亚基的差异性丝氨酸是如何与突变表达方面的。所写捕捉到到位点丝氨酸和突变表达之间的严重威胁，并具体了几个已确定在乳恶性肿瘤发生中都起极为重要作用的突变，以及在LIHC中都功能相对未知的突变。在表达降高的高丝氨酸突变中都，所写考虑了一个LIHC的方面突变FUZ，FUZ的过表达抑制了LIHC肝细胞系的生长(绘出新3)，这详述乳恶性肿瘤丝氨酸相似性与其突变表达方式在和功能方面。

所写看来，DNA丝氨酸可以通过更可靠的病患来尽力病患提高生存率，特别是相对锂或者侵袭性中三状腺。虽然在本文中都只所选了4种典型乳恶性肿瘤，但是所写看来，DNA丝氨酸验证可以科学研究方法于更多不尽相同几类的乳恶性肿瘤诊疗中都，其仅有的优势在于只须要少量的四一个组织获得足够的DNA就可以完成验证。

参考文献：